Bursa’da Yıldırım ilçesinde Yıldırım Bayezıd’ın emirlerinden Kara Eyne Bey tarafından 14. yüzyılın sonunda yaptırılmıştır. Kara Eyne Bey Medresesi olarak da bilinir, ancak burada II. Murad döneminin bilim adamlarından Molla Yegan 15. yüzyılın ilk yarısında uzun süre müderrislik yaptığı için daha çok bu isimle anılır.
Oniki oda ve bir dershaneden oluşan medrese, 1723 yılında geniş çaplı bir onarım geçirmiştir. Günümüze büyük bir avlunun içinde sadece karşılıklı doğu-batı yönünde uzanan iki blok ulaşmış, klasik medrese tiplerindeki derslik ve şadırvan yapılan kazılara rağmen bulunamamıştır. Duvarları bir sıra moloz taş ve üç sıra tuğladan örülmüş olan medrese, karşılıklı iki blok halinde beşik tonozla örtülü altışar odadan oluşmakta olup, çatısı alaturka kiremitle kaplıdır.
Yapı yıllar içinde harap duruma gelmişken Yıldırım Belediyesi tarafından 2006-2007 yılları arasında restore edilmiş, kafeteryaların yanı sıra sergi salonu ve el sanatları kurs atölyeleri bulunduğu bir merkez haline getirilerek, halkın kullanımına açılmıştır. (Kepecioğlu, Bursa Kütüğü, Cilt 4, 241; Bursa Ansiklopedisi, Cilt 3, 1176